En 2013, los visitantes al Museo Aquagraria y la Casa del Colono podrán disfrutar, además de sus exposiciones permanentes, de exposiciones temporales que pretenderán acercar a los niños a los museos, convertir a los no visitantes en visitantes y propiciar que los visitantes de los museos acudan con mayor asiduidad. De este modo, los espacios museísticos albergarán la exposición arqueológica «Los Bañales: una ciudad romana en las Cinco Villas» que analizará la historia y la vida cotidiana en la ciudad romana; la exposición y gymkhana «Los inventos de la innovación» que ayudará a descubrir al innovador que llevamos dentro y ofrecerá la oportunidad de conocer a los inventores más ilustres a través de sus creaciones; y obras de artistas pertenecientes al encuentro de artistas «Encuentra 2012 Cinco Villas».
Como complemento a la actividad de los espacios museísticos, Fundación Aquagraria estudia programar demostraciones de labores agrarias y exhibiciones de maquinaria agrícola antigua. Además, Fundación Aquagraria continuará ejecutando su programa de visitas guiadas y de talleres temáticos dirigidos a la población escolar. Junto a la celebración del Día Mundial del agua, el Día Internacional de los Museos y el Día Internacional de las Mujeres Rurales, se seguirán programando actividades periódicas como «EjeUP: Sesiones de conversación en inglés» y los talleres de cocina en la Casa del Colono de El Bayo.
Fundación Aquagraria también pretende, en colaboración con otras entidades, dar continuidad a eventos cuyas primeras ediciones se celebraron el año pasado en el Museo Aquagraria tales como «Jornada Técnica Agraria ANSEMAT» o «Jornada Técnica de Modernización de Regadíos», que despertaron el interés de gran cantidad de personas.